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Variant BA.2 Covid : 92% en France, quels symptômes ? - Le Journal des Femmes

NOUVEAU VARIANT. Ce sous-variant d'Omicron est majoritaire en France. Il représente 92% des tests positifs au covid. Les anticorps monoclonaux Ronapreve et Evusheld pourraient être utilisés en traitements préventifs contre BA.2 Quels sont ses symptômes ? Quelle est sa dangerosité ? Est-il possible d'être réinfecté ?

[Mis à jour le 11 avril 2022 à 15h40] BA.2 est un sous-variant d'Omicron, lui-même un variant du Sars-CoV-2. BA.2 et responsable de la récente reprise de l'épidémie. Les symptômes d'une infection par BA.2 sont les mêmes que ceux provoqués par Omicron : fatigue, toux, fièvre... Le sous-lignage BA.2 est majoritaire en France, représentant 92% des tests positifs au covid analysés par Santé Publique France selon le point épidémiologique du 7 avril. Il est plus contagieux que le sous-variant BA1 Omicron qui est apparu en premier en France. Mais il ne présente pas plus de dangerosité. Des chercheurs français de l'Institut Pasteur ont étudié l'efficacité des anticorps monoclonaux Ronapreve® (association de deux anticorps développée par Roche/Regeneron) et Evusheld® (association de deux anticorps développée par AstraZeneca) contre le variant Omicron (BA.1 et BA.2) du coronavirus. In fine, BA.1, et dans une moindre mesure BA.2, est moins sensible à Evusheld® et Ronapreve® que Delta.  "Les anticorps et les sérums correspondants sont peu ou pas actifs contre BA.1, mais sont plus actifs contre BA.2. Par rapport à Delta, l'activité neutralisante est plus sévèrement diminuée contre BA.1 : il faut 344 fois plus d'anticorps pour neutraliser BA.1, et 9 fois plus pour neutraliser BA.2", explique Timothée Bruel, premier auteur de l'étude publiée le 23 mars. C'est quoi cette nouvelle mutation du Covid-19 ? Est-elle plus contagieuse, plus dangereuse, qu'Omicron ? Le vaccin est-il efficace contre ce nouveau variant ? Quels sont les symptômes de BA.2 ? Le point à date.

Définition : c'est quoi le nouveau variant BA.2 ?

"Le BA.2 est un sous-variant d'Omicron. C'est un "petit cousin" du variant Omicron" expliquait Jean-François Delfraissy, président du Conseil Scientifique Covid, au micro de Franceinfo en janvier. Nommé BA.2, c'est un sous-lignage d'Omicron comme le BA.1 (qui circulait jusqu'ici) ou le BA.3. "La séquence génétique du sous-variant BA.2 diffère de celle de BA.1 et présente notamment des différences d'acides aminés dans la protéine Spike et d'autres protéines" indiquait l'OMS en février 2022.  "Les données les plus récentes semblent confirmer que BA.1 et BA.2 présentent une sévérité et un échappement à la réponse immunitaire similaires, et BA.2 n'est donc pas considéré comme un variant distinct mais bien comme inclus dans le VOC Omicron" précise Santé Publique France. Cependant BA.2 "est le variant le plus contagieux du virus SARS-CoV-2 que nous ayons vu jusqu'à maintenant", a alerté Maria Van Kerkhove de l'OMS, le 19 mars en conférence de presse.

Quel est le taux du variant BA.2 en France ?

Le variant BA.2 Omicron est désormais plus présent que le variant BA.1 qui circulait majoritairement depuis fin 2021 en France. Au 7 avril, selon Santé Publique France, BA.2 représente 92% des séquences Omicron analysées sur la semaine du 21 au 27 mars. "La progression de BA.2 au détriment de BA.1 est observée sur l'ensemble du territoire métropolitain, mais à des niveaux différents selon les régions. Dans les DROM, BA.2 semble aussi en augmentation mais les données nécessitent d'être consolidées" ajoute l'organisme.

Quels sont les symptômes du variant BA.2 ?

Pour l'instant, il n'y a pas de symptômes spécifiques recensés sur les cas de sous-variants BA.2. En revanche pour le variant Omicron "les investigations épidémiologiques indiquent une présentation clinique spécifique avec plus de symptômes respiratoire hauts et moins de perte de gout et d'odorat, ainsi qu'une sévérité moindre (risque d'hospitalisation et d'admission en soins intensifs jusqu'à 80% plus faible)" a rapporté Santé Publique France le 26 janvier. Les symptômes du variant BA.2 (comme de l'Omicron en général) peuvent être :

  • Grosse fatigue ;
  • Toux ;
  • Fièvre ;
  • Maux de tête
  • Douleurs musculaires ou courbatures ;
  • Maux de gorge ;
  • Ecoulement nasal ;
  • Nausées et vomissements
  • Respiration désagréable (plus rarement)
  • Perte de goût et d'odorat (plus rarement)

Le variant BA.2 est-il plus contagieux qu'Omicron ?

"BA.2 est plus transmissible que BA.1 (taux d'attaque secondaire de 39% pour BA.2 contre 29% pour BA.1). Une étude estime aussi que l'intervalle de génération (délai entre deux cas) de BA.2 est inférieur de 15% à celui de BA.1. Ces différences de transmissibilité expliquent le remplacement progressif de BA.1 par BA.2 observé à l'échelle mondiale" souligne Santé Publique France le 25 mars. BA.2 "est le variant le plus contagieux du virus SARS-CoV-2 que nous ayons vu jusqu'à maintenant", a indiqué Maria Van Kerkhove, épidémiologiste à l'OMS, le 19 mars. 

Proportion des cas de BA.2 parmi le nombre total de séquences déposées sur GISAID, par pays au 21 février 2022
Proportion des cas de BA.2 parmi le nombre total de séquences déposées sur GISAID, par pays au 21 février 2022 © Santé Publique France

Quels sont les risques de réinfection par BA2 ?

La fréquence des réinfections possibles par le SARS-CoV-2 a nettement augmenté depuis l'introduction et la diffusion en France du variant Omicron, début décembre 2021, constate Santé Publique France.

"La reprise à la hausse de la circulation du SARS-CoV-2 observée depuis plusieurs semaines en France et l'émergence du sous-lignage d'Omicron BA.2, majoritaire depuis la semaine 09-2022 sont deux facteurs pouvant jouer un rôle dans la tendance actuelle à l'augmentation du nombre de réinfections" confirme l'agence. Plusieurs études récentes ont mis en évidence la possibilité de survenue d'une réinfection par BA.2 suite à une infection par BA.1, y compris dans un délai très court (inférieur à 60 jours). "Néanmoins elles se rejoignent sur le fait qu'il s'agit vraisemblablement d'évènements rares."

Le variant BA.2 est-il plus dangereux qu'Omicron ?

"Le sous-variant d'Omicron BA2 ne "provoque pas de forme plus grave" du Covid que BA1, selon Maria Van Kerkhove, épidémiologiste en charge de l'unité des maladies émergentes à l'OMS, le 19 mars. Cependant, avec un grand nombre de cas, vous verrez une augmentation des hospitalisations et cela se transformera en hausse des décès...". Elle a précise qu'il n'y a pas "de différence en terme de gravité entre BA1 et BA2". 

"En France, la stratégie de criblage permet de détecter tous les Omicron sans distinction, qu'ils soient BA.1 ou BA.2 et donc de connaître de manière réactive le niveau de circulation du variant" indique Santé Publique France. Dans un deuxième temps, un séquençage permet de faire la différence entre les sous-variants, BA.1 et BA.2 "Le criblage permet de suivre de manière réactive les Omicron dans leur ensemble et le séquençage permet une analyse plus fine des différents sous-lignages [BA.1 ou BA.2]".

Les vaccins sont-ils efficaces contre le variant BA.2 ?

"L'efficacité du vaccin contre la maladie symptomatique provoquée par BA.1 et BA.2 est similaire : après deux doses l'efficacité est de 10% pour BA.1 et 18% pour BA.2, après trois doses l'efficacité contre la maladie symptomatique est de 69% pour BA.1 et 74% pour BA.2. L'efficacité tombe à près de 50% deux mois et demi après la 3e dose pour BA.1 et BA.2" selon l'étude de l'agence sanitaire britannique publiée le 25 février. "Cela suggère que la vaccination est au moins aussi efficace pour prévenir l'acquisition du BA.2 et pourrait être plus efficace pour prévenir la transmission du BA.2 que du BA.1", a remarqué l'OMS. "L'efficacité vaccinale est conservée contre Omicron après l'administration d'une dose de rappel, en particulier contre les formes sévères" avait confirmé Santé Publique France le 26 janvier.

Quels traitements pour prévenir l'infection au variant BA.2 ?

Plusieurs traitements par anticorps monoclonaux sont disponibles pour prévenir l'infection au Covid-19. Des chercheurs de l'Institut Pasteur, du CNRS, du Vaccine Research Institute (VRI), en collaboration avec le CHR d'Orléans, l'AP-HP, KU Leuven (Université Catholique de Louvain) et Université Paris Cité ont étudié l'efficacité de deux associations d'anticorps monoclonaux thérapeutiques Ronapreve (association de deux anticorps développée par Roche/Regeneron) ou Evusheld (association de deux anticorps développée par AstraZeneca) contre le variant Omicron (BA.1 et BA.2) du coronavirus. "Nous montrons que les anticorps et les sérums correspondants sont peu ou pas actifs contre BA.1, mais sont plus actifs contre BA.2. Par rapport à Delta, l'activité neutralisante est plus sévèrement diminuée contre BA.1 : il faut 344 fois plus d'anticorps pour neutraliser BA.1, et 9 fois plus pour neutraliser BA.2", explique Timothée Bruel, premier auteur de l'étude publiée le 23 mars dans Nature Medicine et chercheur au sein de l'unité Virus et immunité à l'Institut Pasteur (unité mixte de recherche CNRS). Quatre infections à Omicron ont été décrites parmi les 29 patients traités par anticorps (dont un cas sévère). "Cela indique que, dans ce cas, le traitement ne protège pas complètement ni contre l'infection, ni contre les formes sévères" explique Thierry Prazuck, co-auteur principal de l'étude et chef du service maladies infectieuses au CHR d'Orléans.

Sources :

- "Neutralisation sérique des sous-lignées SARS-CoV-2 Omicron BA.1 et BA.2 chez les patients recevant des anticorps monoclonaux", Nature Medicine, 23 mars 2022

- "SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England", Agence sanitaire britannique, 25 février 2022

- "Coronavirus : circulation des variants du SARS-CoV-2', mis à jour le 25 février 2022, Santé Publique France

-"BA.2 est plus transmissible que BA.1 mais les personnes vaccinées sont moins susceptibles d'être infectées et de transmettre l'infection", 31 janvier, Statens Serum Institut.

- COVID-19 : point épidémiologique du 27 janvier 2022, Santé Publique France

- "Analyse de risque sur les variants émergents du SARS-CoV-2", 26 janvier 2022, Santé publique France.

-"Maintenant, une variante d'Omicron, BA.2, représente près de la moitié de tous les cas d'Omicron danois" 20 janvier 2022, Statens Serum Institut.

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